Rengeteg szoftverkiadó nagyon alacsony színvonallal fontolja meg a Linux piacot, és nem kívánnak szoftvert kiadni a Linux számára. Ám ez jelenti a kezdetet a változáshoz, de a legtöbb szabadalmazott szoftver nem fut a Linux-al.
Már meg lett említve, hogy van néhány nyílt forráskodú program, ami lecserélheti ezeket a "lényeges" szabadalmazott szoftvereket, más szóval ezek az alternatív változatok (lásd ezt a szekciót).
Próbáld ki ezeket a programokat; gyakran kiadnak Windows verziókat is, amelyeket használhatsz. Nézz körül a képeiknél és a tulajdonságaiknál, és gondolkodj el azon, hogy ez kielégíti -e az igényeidet.
Ha van egy szoftvered, ami nélkül abszolút nem tudsz dolgozni, akkor a Windows megtartása jó döntés. Mind a két rendszert fel lehet telepíteni egy merevlemezre (gyakran hívják "dual-booting" azaz "kettős boot"-nak), ami használható ahoz, hogy kielégítse az igényeidet.
Van egy projekt is, amit "Wine-nak" hívnak, amely néhány esetben, futtatni tudja a Windows alkalmazásokat Linuxban. Megtekintheted a weboldalukat, amelyen a kompatibilis szoftvereknek a listáját is megtalálhatod: www.wineHQ.org. Egy másik lehetőség emulálni a Windows-t a Linuxon belül, habár ez tipikusan nem megfelelő 'magas-szintű' programok futtatására.